Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Cpne9Q1RLL3 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.9 ms