Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms