Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LmnaP48678 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LmnaP48678 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms