Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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VdrP48281 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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VdrP48281 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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VdrP48281 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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