Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Hoxd10P28359 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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Hoxd10P28359 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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Hoxd10P28359 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms