Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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