Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ggta1P23336 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ggta1P23336 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms