Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TtrP07309 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TtrP07309 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TtrP07309 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TtrP07309 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TtrP07309 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TtrP07309 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TtrP07309 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TtrP07309 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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