Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Speer3W4VSP1 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Speer3W4VSP1 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Speer3W4VSP1 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Speer3W4VSP1 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms