Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms