Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms