Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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