Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms