Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms