Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Cntn3Q07409 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Cntn3Q07409 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Cntn3Q07409 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Cntn3Q07409 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Cntn3Q07409 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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