Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms