Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprkP35822 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms