Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RxraP28700 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RxraP28700 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms