Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms