Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms