Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms