Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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