Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ChmQ9QXG2 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ChmQ9QXG2 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms