Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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