Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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Tlr5Q9JLF7 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms