Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms