Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Snx8Q8CFD4 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms