Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp27Q8CEG8 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms