Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp46P62069 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp46P62069 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms