Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp1P55194 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms