Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms