Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxd9P28357 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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