Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PdgfraP26618 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PdgfraP26618 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PdgfraP26618 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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PdgfraP26618 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PdgfraP26618 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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