Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Usp9yF8VPU6 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms