Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Col5a3Q9JLI2 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms