Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms