Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Ccdc18Q640L5 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Ccdc18Q640L5 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Ccdc18Q640L5 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Ccdc18Q640L5 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms