Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms