Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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