Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sh3bp1P55194 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sh3bp1P55194 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sh3bp1P55194 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Sh3bp1P55194 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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Sh3bp1P55194 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Sh3bp1P55194 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp1P55194 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms