Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Hoxd10P28359 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd10P28359 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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