Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtpraP18052 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtpraP18052 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms