Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Opn1mwO35599 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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