Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms