Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms