Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn2r25W4VSP2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn2r25W4VSP2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms