Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms