Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms