Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cldn6Q9Z262 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn6Q9Z262 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cldn6Q9Z262 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Cldn6Q9Z262 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Cldn6Q9Z262 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Cldn6Q9Z262 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Cldn6Q9Z262 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Cldn6Q9Z262 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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