Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HnrnpcQ9Z204 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms